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Localización especifica: 03°47'S 70°32'W
Superficie: 45 464 hectáreas
Es el primer humedal protegido de la Amazonia siendo designado como tal el 28 de septiembre del 2017.
Flora y fauna: Los Lagos de Tarapoto sustentan especies de plantas y animales como las ceibas (Ceiba pentandra), caimanes negros (Melanosuchus niger), 136 especies de peces, incluyendo el pez de agua dulce más grande que se conoce, el pirarucu (Arapaima gigas), y más de 153 especies de aves. Los delfines grises y rosados (Inia geoffrensis y Sotalia fluviatilis) usan el sitio como hábitat para enseñar a sus crías siendo clave para su crianza pues aquí aprenden a pescar. También alberga mamíferos amenazados como el tapir (Tapirus terrestris), el arm
adillo gigante (Priodontes maximus), el manatí amazónico (Trichechus inunguis), la nutria gigante (Pteronura brasiliensis) y el oso hormiguero (Myrmecophaga tridactyla). Esta gran biodiversidad y en particular sus recursos pesqueros sustentan a las 22 comunidades del resguardo indígena TICOYA (Ticuna, Cocama y Yagua).
Las aguas en este ecosistema pasa por etapas diversas en cuanto a altura a lo largo del año teniendo épocas altas y épocas bajas en las altas se puede llegar a los 14 metros de profundidad.
Se ha demostrado preocupación dentro del país y dentro de la comunidad indígena que ahí vive que se a preocupado de la zona al punto de capacitarse en cuanto a la pesca para cuidar las especies que ahí viven.
Este ecosistema además provee importantes funciones tales como el control de inundaciones y erosión, transporte fluvial, recreación y turismo. La designación del Complejo de Humedales Lagos de Tarapoto como humedal de importancia internacional fue alcanzada tras completar el proceso de consulta y el acuerdo entre autoridades indígenas, nacionales y regionales para proteger el sitio.
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